全面!详实!标准!器官芯片数据库OCDB正式上线!_器官芯片网
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全面!详实!标准!器官芯片数据库OCDB正式上线!

作者:器官芯片网 日期:2022-05-13 08:41:32 点击数:

近日

由东南大学顾忠泽院长领衔的

器官芯片数据库OCDB

正式上线


全面!详实!标准!器官芯片数据库OCDB正式上线!(图1)


器官芯片的诞生


传统的临床药物研究通常采用二维细胞培养模型和动物模型,但由于体外单层细胞与天然组织的结构不同,以及传统体外细胞培养对不同器官和组织之间相互作用的总结能力有限,无法准确检验药物筛选的疗效。另外,经过动物模型的初步筛选,由于人与动物的种间差异,很多药物即使通过了动物模型的筛选,但由于对人体有毒性或疗效不明显而不能通过临床试验。


因此,迫切需要一种新的技术来实现体外病理和生理模型的构建,片上器官技术应运而生。


器官芯片是一种体外微流控微生理系统,模拟人体组织和器官的结构和功能特征。它通过使用微加工技术、细胞培养、生物材料和其他方法建立在微流控芯片上。它不仅可以在体外对活体人体细胞的结构和功能进行高分辨率的实时成像分析,还可以消除传统药代动力学研究中因复杂代谢造成的不确定性。


近年来,各种芯片上的器官技术已经被开发出来。这些器官芯片由不同器官的特定细胞类型组成,可用于模拟相应的器官,包括肺部芯片,肝脏芯片,角膜芯片,心脏芯片等等。


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由于片上器官技术的发展,不同器官的疾病建模数据出现了爆炸性增长。然而,人体器官芯片结构的复杂性、测量的内涵和大数据的快速发展也阻碍了器官芯片数据的应用。


为了更好地为未来的研究做准备,为科研人员、药物研发及医疗领域的专家学者提供一个全面的、可检索的数据库,顾忠泽院长带领团队成员构建了OCDB(片上器官数据库)数据库。







OCDB数据库


OCDB数据库地址

http://www.organchip.cn/?lang=en_US


OCDB是一个标准化的系统,拥有大量的图表、文献和专利信息。此外,我们数据库的内容会定期更新。每周都会收集相关文献、专利等信息,向研究人员通报最新进展和研究热点。


OCDB具有以下优势:

1. 我们的数据库分为文献、专利、药物、毒物、化学品等栏目,每个栏目都包含一些开放的数据。该数据库内容全面,数据详实。此外,OCDB中还有大量的实验室生成的数据,这些数据是对公开数据的补充,共同构成了OCDB的数据源。


2. 我们的数据库处理芯片上的器官相关数据,对数据的作者、发表时间、发表单位进行分析,为研究者提供最新研究成果的分析。


3. 我们的数据库还可以为研究人员提供免费的在线工具,如数学模型允许研究人员上传自己的数据,或他们感兴趣的数据。这些数据将通过组织富集分析来确定基因富集的器官,从而与自己的实验结果相对应,为研究提供参考,进一步推动器官芯片的数据交换和共享,对于加快器官芯片的研究,征服复杂疾病具有重要意义。



目前,OCDB已经收集到107,873份相关文献数据,16,841份组织学数据和12,002份专利数据。我们从文献、专利和组织学数据中提取了药物、毒素、化合物和设备信息。我们根据关键词从Drugbank, ChEMBL, CTD, EMA获得了相关的开放存取数据,对于非开放存取数据,我们提供了原始网站的链接。共收集到14020条药物数据,17070条毒物数据,4986258条化合物数据和160条器械数据。



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